後龍站於民國11年10月11日通車，原名為「後龍驛」，民國58年由原來的杉木改建為鋼筋混凝的站房，由於鐵路造成後龍地區東西向交通阻隔，影響市區發展，台鐵納入「台灣鐵路更新軌道結構計畫」於92年3月進行縱貫線下新港溪橋及引道改建工程，後龍站是目前海線唯一高架化車站，後龍火車站及市區鐵道路段高架及雙軌化，總經費12億1千餘萬元。